ارائه روشی جدید برای تست گروهی غربالگری کووید ۱۹
محققان کشور موفق به ارائه روشی نوین برای تست گروهی افراد درغربالگری کووید ۱۹ شدند که علاوه بر کاهش تعداد تست، باعث کاهش میزان نتایج منفی کاذب نسبت به سایر روشهای متداول تست گروهی میشود.
به گزارش خبرنگار مهر، دکتر امیررضا علیزاد، عضو هیأت علمی پژوهشکده علوم زیستی پژوهشگاه دانشهای بنیادی گفت: لازم است همزمان با دوران بیماری کووید ۱۹ و رفع محدودیتهای اجتماعی و بازگشایی کسب و کارها، غربالگریهای گروهی از افراد حاضر در یک سازمان و مجموعه انجام شود تا در صورت ابتلای تعداد اندکی از افراد، آنها سریعاً قرنطینه شوند و باعث آلوده شدن سایر نیروهای فعال نشوند. بدین منظور، بهتر است به جای استفاده از یک کیت تشخیص برای هر نفر، از روشهای تست گروهی استفاده شود تا به تعداد کمتری تست برای تشخیص افراد مبتلا در یک گروه نیازمند باشیم.
وی خاطرنشان کرد: در روش تست گروهی، نمونههای چندین نفر با یکدیگر مخلوط شده و تنها از یک تست برای این نمونهها استفاده میشود. در صورتی که پاسخ این تست منفی باشد، پاسخ تست همه اعضای این گروه منفی تلقی میشود و عدم تست انفرادی تک تک افراد این گروه باعث کاهش تعداد تست لازم میگردد. در صورت مثبت شدن نتیجه تست یک گروه، باید نمونههای هر یک از اعضای گروه به صورت انفرادی تست شوند تا فرد یا افراد آلوده شناسایی شوند.
علیزاد با اشاره به اینکه تست گروهی روش جدیدی نیست و از زمان جنگ جهانی دوم برای غربالگری بیماریهای مختلف استفاده می شده تصریح کرد: تمام روشهای تشخیص بیماریهای مختلف، دارای احتمال بروز خطای منفی کاذب (عدم تشخیص فرد مبتلا به بیماری) میباشند. منتها این خطا در روش RT-PCR که رایجترین روش تشخیص بیماری کووید ۱۹ میباشد، به مراتب بیشتر است که همین مورد میتواند باعث آسیب پذیری روشهای تست گروهی برای تشخیص بیماری کووید ۱۹ شود. اگر در یک گروه، فرد یا افراد آلودهای باشند و نتیجۀ تست گروه منفی کاذب شود، باعث میشود که افراد آلوده آن گروه قرنطینه نشوند و وارد اجتماع شده و سبب آلودگی سایر افراد شوند. لذا لازم است از روشی برای تست گروهی استفاده شود که علاوه بر کاهش تعداد تست لازم، در برابر منفی کاذب نیز از مقاومت بیشتری برخوردار باشد.
علیزاد خاطرنشان کرد: در تست گروهی کووید ۱۹ در دو جا ممکن است خطای منفی کاذب اتفاق بیافتد. یکی در تشخیص گروه دارای فرد آلوده و دیگری در تست فردی روی اعضای این گروه که در مورد تست فردی کاری نمیتوانیم کنیم، ولی موفق شدهایم با الگوریتم ارائه شده، حساسیت و دقت تشخیص گروه دارای فرد آلوده را بالا ببریم.
وی تصریح کرد: اگر برای شناسایی افراد آلوده از روش معمول (تست فردی) استفاده شود و ۲۰ درصد در تشخیص فرد آلوده خطای منفی کاذب داشته باشیم، احتمال پیدا کردن فرد آلوده ۸۰ درصد است. اگر از روشهای تست گروهی معمول استفاده کنیم که ۲۰ درصد در تشخیص گروه دارای فرد آلوده و ۲۰ درصد در تشخیص فرد آلوده خطا دارند، احتمال پیدا کردن فرد آلوده ۶۴ درصد است. در حالی که اگر از روش تست گروهی مبتنی بر الگوریتم ارائه شده در تحقیقات ما استفاده شود، احتمال تشخیص گروه آلوده از ۸۰ درصد به ۹۶ درصد افزایش مییابد و در مجموع احتمال تشخیص فرد آلوده از ۶۳ درصد به ۷۷ درصد افزایش مییابد.
وی خاطرنشان کرد: روش پیشنهادی، برای آزمایش غربالگری بر روی پرسنل پژوهشگاه دانشهای بنیادی مورد استفاده قرار گرفت. در این غربالگری، در مجموع ٢۶٣ نمونه وجود داشت که با استفاده از روش پیشنهادی، تنها نیاز به ٩٨ تست بود که در انتها دو فرد آلوده به بیماری کووید ۱۹ تشخیص داده شدند. به عبارتی، در مقایسه با روش آزمایش فردی، ۶٣ درصد در تعداد تستهای مورد نیاز صرفه جویی شد.
عضو هیأت علمی پژوهشگاه دانشهای بنیادی تصریح کرد: وبگاهی به نشانی groupmix.ipm.ir طراحی شده است تا آزمایشگاهها را برای پیاده سازی این روش جدید غربالگری راهنمایی کند.
در ادامه دکتر صادقی، رئیس پژوهشکده علوم زیستی پژوهشگاه دانشهای بنیادی هم با اشاره به راهبردهای مختلفی که برای مقابله با ویروس کووید ۱۹ در دنیا پیش گرفته شده است گفت: در همان ابتدا که این بیماری بروز کرد معلوم بود که تولید دارویی جدید برای آن بسیار دور از ذهن است، لذا سراغ داروهایی رفتند که از قبل برای استفاده در سایر بیماریها عرضه شده یا در مرحله تولید یا تست بودند.
وی گفت: در مورد واکسن هم مشخص بود که تهیه و انجام تستهای بالینی حداقل دو سال زمان میبرد اما استراتژی سوم که اغلب کشورهای موفق از آن استفاده کردند شکستن زنجیره انتقال بیماری با شناسایی بیماران بود.
وی خاطرنشان کرد: البته این استراتژی هم محدودیتهای خاص خود را دارد. ایراد اساسی این جاست که ممکن است افرادی که برای تست مراجعه میکنند در دوره نهفتگی بیماری باشند که ویروس چندان قابل تشخیص نیست، اما فرد مبتلا میتواند با سرعتی بالا ویروس را منتقل کند.
صادقی تصریح کرد: روش دیگری که برای شناسایی افراد آلوده به این ویروس وجود دارد، غربالگری عمومی به صورت تصادفی است. کاری که چین انجام داد و توانست قبل از واکسیناسیون مردم علیه ویروس، انتقال بیماری را کنترل کند. استراتژی چینیها بدین صورت بود که اگر مثلاً در یک شهر پنج میلیون نفری، چهار نفر بیمار گزارش میشد، ظرف چند روز از همه تست میگرفتند و بدین ترتیب تمام کانونهای انتشار را در نطفه خفه کردند.
وی خاطر نشان کرد: در اکثر کشورها به جای غربالگری عمومی از مردم خواسته شده در صورتی که علائم بیماری کووید ۱۹ را در خود یا اطرافیان دیدند، فرد مشکوک را برای دادن تست تشخیصی به مراکز بهداشتی درمانی ببرند. در حالی که هزینه انجام تست برای اکثر خانوادهها بسیار بالاست. این در شرایطی است که با روش تست گروهی میتوان مثلاً در عرض چند روز پنج میلیون نفر را غربالگری کرد.
صادقی تصریح کرد: پیشنهاد ما به وزارت بهداشت این است که با توجه به هزینهها و زمان کمتر مورد نیاز، از تستهای گروهی به عنوان راهبردی مناسب برای شناسایی مبتلایان به کووید ۱۹ استفاده کند. البته با توجه به حساسیت پایین روش PCR که در تست گروهی هم استفاده میشود و میتواند مشکل سازتر از تستهای فردی باشد، توانستیم الگوریتمی ارائه کنیم که در غربالگری گروهی انجام شده در پژوهشگاه دانشهای بنیادی هم دقت بالای خود را اثبات کرد.
وی در پاسخ به این سوال که تستهای گروهی در چه شرایطی بهتر جواب میدهند گفت: تست گروهی برای غربالگریهایی است که احتمال ابتلای دو، سه درصد جمعیت مورد نظر را میدهند و برای شناسایی افراد علامتدار که مثلاً ممکن است ۵۰ درصد آنها بیمار باشند مناسب نیست.
صادقی با بیان اینکه تست گروهی حداقل در شهرهای کوچک - که اتفاقاً کانونهای اصلی آلودگی هم هستند - قابل استفاده است اظهار داشت: اگر مدیریت با ارادهای باشد، یک شهر ۲۰ هزار نفری را میتوان ظرف مدت کوتاهی با ۷ هزار و ۵۰۰ تست غربالگری و افراد آلوده به ویروس را شناسایی کرد.
وی در پاسخ به این سوال که در تست گروهی چند نمونه را میتوان با هم تست کرد گفت: وقتی نمونهها روی هم ریخته میشوند و رقیق و رقیقتر میشوند، دقت و حساسیت تشخیص پایین میآید. البته اینکه تعداد بهینه نمونههای قابل تست به روش تست گروهی چه قدر است به الگوریتم استفاده شده، جمعیت مورد بررسی و شرایط آن و پیش بینی و حدس اولیه (درباره درصد مبتلایان در جمعیت مورد بررسی) و محدودیتهای عملی دستگاه تشخیص بیماری بستگی دارد که بررسیهای ما نشان داده است که برای غربالگری کووید ۱۹ بهتر است از پنج یا شش نمونه تجاوز نکند.
صادقی تصریح کرد: به موازات کار بر روی الگوریتمهای تست گروهی سعی کردهایم دستگاهی فیزیکی هم تولید کنیم که به روشی سریعتر، دقیقتر، کم هزینه تر و آسانتر از PCR قادر به تشخیص نمونههای آلوده به ویروس باشد.